吉木萨尔县位于天山山脉东段北麓，准噶尔盆地东南缘，东同奇台县为邻，西与阜康市接壤，北越卡拉麦里山和富蕴相连，南以博格达山分水岭同吐鲁番市、乌鲁木齐县为界。县城西距自治区首府乌鲁木齐市165公里，距昌吉回族自治州首府昌吉市200公里，东离哈密市550公里，吐—乌—大高等级公路、国道216线及省道303线贯穿全境，交通便利。县域总面积8848平方公里，辖5乡4镇，境内有新疆生产建设兵团农六师的2个团场，总人口13.2万人，有汉、回、哈萨克、维吾尔、蒙古等13个民族，其中少数民族人口占28％。

    吉木萨尔县气候独特，四季分明，年平均气温6.5℃，年均降水量183毫米，水资源总量4.4亿立方米，现有耕地64.14万亩、各类草场888万亩、林地53.7万亩。南部山间盆地具有天山北坡独有的逆温带气候，年降雨量355mm左右，中部平原是绿洲农业区，独特的气候水土条件，丰富的生物资源，使吉木萨尔县成为各类农产品盛产区，其中尤以红花、番茄、大蒜等特色农产品享誉区内外。全县已有大蒜、马铃薯等20种无公害农产品和7个无公害农产品基地顺利通过自治区认证，其中大蒜、红花、肉苁蓉、羊四个生产基地和一个190吨有机羊肉加工厂顺利通过国家有机食品认证中心的认证（简称OFDC）。我县已被国家评为“大蒜之乡”、“黑加仑之乡”和“高淀粉马铃薯之乡”。近年来，我县加大特色农业资源整合力度，积极推进特色农产品生产的规模化、标准化和产业化，重点培育发展番茄、高淀粉土豆、特色林果等支柱产业，狠抓招商引资工作，先后引进和扶持壮大了新疆屯河北庭番茄制品公司、新疆三台酒业有限责任公司、天山飞雪、汇昌油脂、博林科技、庄子实业等一批农产品加工龙头企业，农业产业化发展初具规模。

    吉木萨尔县虽无江南优美的风光，却有着众多的自然和人文景观：历史悠久的北庭故城、西大寺，浩渺的大漠风光，独一无二的古海温泉、野马中心，神奇的古生物化石硅化木，气候宜人的青松森林公园，贯穿天山通往吐鲁番的车师古道以及沿途的龙沟遗址、高山神泉、天堑石堡等险峻而优美的原始奇景是旅游观光者流连往返。南部天山是国家天然林保护区，马鹿、天山雪鸡、野山羊、牦牛等珍稀野生动物活动其间。北部沙漠有国家二级有蹄类动物保护区－－卡拉麦里山自然保护区，是野驴、黄羊的乐园和普氏野马的故乡，有国内和世界唯一的普氏野马繁殖中心，有国家AAA级景区－－五彩湾温泉度假村。吉木萨尔县曾为丝路古道重要的政治、军事、经济和文化中心，汉时为车师后国，盛唐时设北庭大都护府，辖天山以北、巴尔喀什湖以东以南广大西域地区。境内北庭故城及高昌回鹘佛寺遗址为国家级重点文物保护单位，还有千佛寺、车师古道、疏勒古城遗迹、小西沟遗址等30余处自治区、自治州级文物保护单位。主要旅游景点有：车师古道、北庭都护府城址和北庭西大寺（高昌回鹘佛寺）、千佛寺、普氏野马繁殖中心、沙漠温泉和沙漠狩猎场，以及大龙口沟、渭户沟、吾塘沟、花儿沟、牛圈子沟等天山自然景观。