广东省港口协会原称广东省内河港口协会，成立于1984年10月。由当时的广东省航运总公司发起组建，九十年代改为现名。协会在省民间组织管理部门办理了注册登记手续，并接受广东省民政厅的监督管理及广东省交通主管部门和相关职能部门的业务指导。省港口协会坚持以服务行业、服务会员和服务港口经济发展为宗旨。协会定位为广东省全省性的港口行业协会。协会是具有法人资格的、非营利性的社会中介团体

根据2006年3月1日施行的《广东省行业协会条例》精神，协会已进行了民间化改革。根据2006年11月六届一次会员大会通过的《广东省港口协会章程》规定，本会的会员为广东省内港口企业、相关科研机构和单位。协会建立了会长、理事会和会员大会三级管理机构，并设立了监事会，对协会工作进行监督。协会领导人由会员大会选举产生：现任会长陈洪先（广州港集团有限公司董事长），谢鉴明、郑日强、温锡通等8人任副会长（均为省内知名大中型港口企业领导人），监事会由监事长邵国坤（佛山新港有限公司董事长兼总经理）及4位监事组成。协会聘任徐炳澄同志担任秘书长。现任名誉会长为陈自昌（省交通厅副厅长）和陈庆年（省交通厅助理巡视员）。邓立文（省交通厅港航管理局局长）和罗国才（省交通厅港航局港口处处长）等5人任顾问。协会设立秘书处和生产经营委员会、工程技术委员会等4个专业委员会，承担协会各项具体工作

本协会现拥有单位会员70多个，覆盖全省各个水域的主要港口企业。协会坚持“入会自愿，退会自由”的原则。会员拥有《章程》规定的权利和义务。协会的经费来源主要是单位会员交纳的会费和其他有偿服务收入。