额济纳旗地处祖国北疆,位于内蒙古自治区最西端。东与阿拉善右旗毗邻,西南与甘肃省酒泉市交界,北与蒙古国接壤,国境线全长507.147公里。相对中心城镇达来呼布镇和东风镇。达来呼布镇距自治区首府呼和浩特市1398公里,距阿拉善盟府所在地巴彦浩特640公里。夏、商、周时属乌孙。秦朝为大月氏领地。西汉初年为匈奴牧地。西汉元狩二年(公元前121年),骠骑将军霍去病入居延收河西,史籍始见“居延”(匈奴语,意为天)。汉太初三年(公元前102年),置居延都尉府,后又置“张掖居延属国”。汉献帝建安末,改立西海郡。唐代设安北都护府和宁寇军。西夏设黑水镇燕军司。成吉思汗二十一年(公元1226年)春,归属蒙古帝国。元世祖至元二十三年(公元1286年),设亦集乃路总管府。明洪武五年(公元1372年)后,为漠北鞑靼领主牧地。清乾隆十八年(公元1753年),设置额济纳旧土尔扈特特别旗。民国初年,直属国民政府蒙藏委员会,由宁夏护军兼辖。1928年11月,隶属宁夏省政府管辖。1949年9月27日,额济纳旗和平解放,初由甘肃省酒泉专署代管。1951年2月,复归宁夏省直辖。1954年11月,初由张掖专署代管,同年11月30日,改隶酒泉专署。1956年6月1日,划归内蒙古自治区巴彦淖尔盟。1969年9月9日,划归甘肃省酒泉地区。1979年7月1日归属内蒙古自治区。1980年5月1日,隶属阿拉善盟。
2005年,额济纳旗辖3个苏木、2个镇、1个国营农场及13个嘎查、1个社区、4个居民委员会、8个生产连队。是一个以蒙古族为主体、汉族居多数的多民族聚居的边境旗。总人口16874人。其中,男性8602人,女性8272人。非农牧业人口11286人。有蒙古、汉、回、满、藏、土家等10个民族。少数民族人口5188人,其中蒙古族4891人、回族190人、满族55人、藏族8人、土家族16人,其他民族28人。旗境东西最长488.59公里,南北最宽处324.22公里。总面积11.46万平方公里,人口密度为每平方公里0.147人。2005年,耕地总面积0.291万公顷,人均耕地面积0.57公顷。宜耕地0.166万公顷,草场面积697.05万公顷,可利用草场面积253.6万公顷,林地面积38.6738万公顷,戈壁面积6.48万平方公里,其中沙漠面积1.55万平方公里。