咸安区地处幕阜山系和江汉平原的过渡地带，地势东南高西北低，呈阶梯状分布，状如撮箕，按形态成因为分低山、丘陵、岗地、平原四大类型，相对高差936.1米。东南南部和西南部为低山区，系幕阜山系北翼余脉，山脉之间峰峦起伏，沟壑纵横，共形成大小山丘22877座，其中山峰218座，最高峰为大幕山灶背岩，海拔954.1米。相对高差50－200米，谷深坡陡，坡度为60°左右。中部和东部为丘陵区，海拔50－300米，相对高差50－100米，丘体零乱、圆浑，坡度50－300米，垄岗、残丘相间，脉络明显，坡度小于5°左右。北部和东北、西北、西部部分为平原区，海拔30米以下，最低处斧头湖海拔18米，地势平坦，湖泊港汊多，河网密度大，坡度小于3°。

本区西南部、咸安区南部东南部地表广泛分布石灰岩，属喀斯特地貌，溶洞特多，较大的有20余处，其中太乙洞、飞仙洞、鸣泉洞等最为有名。这些溶洞多有伏流泉眼，全区已发现的有地下泉眼169处，其中以温泉、鸣水泉、三十六人泉为著。