2003年中、科两国政府换文确认开始实施新航站楼建设项目。项目包括：建筑面积为2587.3平米的航站楼（配备所有机场运行设备），新铺沥青混凝土跑道28350平米，停机坪修补23850平米，新建停机坪19309平米，围界4700米，停车场2800平方米。

上午9时，新航站楼交接和启用仪式隆重举行。科摩罗总统桑比及全体内阁成员、驻科使团和国际组织代表、各界代表和中国政府经贸代表团成员等近千人出席仪式。

桑比在仪式上发表讲话，他首先向中国四川汶川强烈地震的受灾群众表示慰问，并提议为遇难者默哀一分钟。他同时表示，新航站楼是中国人民献给科摩罗人民的又一份厚礼。它的建成将有助于改善科摩罗的交通闭塞状况，促进经济发展。